Касперский: http://www.kaspersky.ru/scanforvirus 
DrWeb: http://www.drweb.ru/scan 
ESET Online Scanner: http://www.eset.com/onlinescan/index.php 
VirusTotal (комплексная проверка): http://www.virustotal.com 
VirSCAN.org (комплексная проверка): http://virscan.org 
Anubis (онлайновый поведенческий анализатор): http://anubis.iseclab.org